植物人工气候室控制系统主要目的通过对空调机组、排风机及生长灯等设备的控制保证实验室温湿度相对恒定及微正压的要求。

本系统采用SIMATIC S7-200系列PLC。三个实验室设置三套独立的PLC系统分别控制，实验室门口安装有各自的液晶触摸式的控制面板，触摸屏面板能方便的监控整个实验室系统，实现各种控制功能：远程开关系统、温湿度设定、房间压力设定、生长灯的开启和关闭时间设定以及查看报警及确认报警。每个空调机组本身也配置了一个SIMATIC S7-200控制器（控制器在吊顶内相应的机组控制箱内空调机组内部的设备及连锁均有该控制器控制），该控制器根据实验室回风温湿度控制室外压缩机或电加热的启停和电加湿段的加湿器的启停使室内温湿度达到要求，并有一些保护连锁措施。实验室PLC通过MODBUS协议读取空调机组PLC内部数据。

北京低碳能源研究所是神华集团成立的级能源科研机构实验室，重点开展低碳能源应用基础研究、应用技术开发与集成、新能源发展战略和技术路线研究。

实验室末端通风控制由高性能的Phoenix文丘里阀及相关控制部件一起完成通风柜面风速及补风控制功能。以房间为单位，采用Phoenix变风量控制文丘里阀及其气流控制解决方案，独立完成通风柜面风速控制和房间补风控制功能。

101单元和104单元分别配置一套Honeywell公司的SymmetrE系统：实验室空调、风机控制以层为单位，采用Honeywell的Excell800控制器，就地独立完成全部设备启停、风机变频调节、送风温湿度调节及报警等控制功能以及实现数据采集上传、余风量修正及紧急状态控制等控制功能。